Bij een gastroscopie of maagonderzoek wordt de slokdarm en maag met een flexibele camera van binnenuit bekeken. Als de diagnose achalasie nog niet met zekerheid is gesteld, wordt er altijd een gastroscopie gedaan, dit om zeker te zijn dat er niet iets anders aan de hand is. De diagnose achalasie zelf kan niet met een gastroscopie worden gesteld, hiervoor is een slokdarm manometrie nodig.

Bij patiënten die al jaren de ziekte hebben wordt er periodiek een gastroscopie verricht waarbij een kleurstof wordt gespoten in de slokdarm. Op deze manier kunnen eventuele onrustige cellen die een voorstadium kunnen zijn van slokdarmkanker worden opgespoord.